Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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