Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms