Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms