Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 CCDC42-201ENST00000293845 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 FAM157C-201ENST00000563357 1806 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 TMEM186-201ENST00000333050 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TM4SF4P48230 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 FAM238C-202ENST00000639963 1787 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 HIGD2B-201ENST00000311755 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 SFTPA2-202ENST00000372327 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 AC012513.2-201ENST00000441511 1137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 TCEA3-204ENST00000461794 713 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 EFNA5-204ENST00000509503 637 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 FAM213AP2-201ENST00000521579 683 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 AC004923.1-201ENST00000527543 776 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 ALG10-202ENST00000538927 571 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 AC116552.1-201ENST00000563243 733 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 MT1L-201ENST00000565768 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 AC010601.2-201ENST00000623060 774 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 LINC01002-223ENST00000633179 407 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 DEGS1-202ENST00000391877 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 FAHD2A-204ENST00000447036 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 CEBPZOS-203ENST00000397226 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 AC011239.2-201ENST00000624820 1489 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 SIGLEC17P-204ENST00000618545 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 TRIML2-207ENST00000512729 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 RPS6-201ENST00000315377 863 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 PSMA7-202ENST00000370861 773 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 NPPB-201ENST00000376468 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 SPTLC1P3-201ENST00000403408 259 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 GAPDHP29-201ENST00000429913 985 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 Z84721.1-201ENST00000438841 372 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 AC008267.3-201ENST00000448776 712 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 ABCC6P2-201ENST00000526069 590 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 FTH1-205ENST00000529631 507 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 NEMF-210ENST00000556672 590 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 GACAT2-201ENST00000579368 818 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 AL139220.2-222ENST00000627999 756 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 AL590094.1-206ENST00000635959 478 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 AL590094.1-209ENST00000637260 499 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 AC099795.2-201ENST00000639582 440 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM4SF4P48230 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms