Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHTF1Q9UMS5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHTF1Q9UMS5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms