Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG4

SLC13A4, Solute carrier family 13 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A4Q9UKG4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC13A4Q9UKG4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC13A4Q9UKG4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC13A4Q9UKG4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC13A4Q9UKG4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC13A4Q9UKG4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC13A4Q9UKG4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC13A4Q9UKG4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC13A4Q9UKG4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC13A4Q9UKG4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC13A4Q9UKG4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC13A4Q9UKG4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC13A4Q9UKG4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC13A4Q9UKG4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC13A4Q9UKG4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC13A4Q9UKG4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms