Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GDE1Q9NZC3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GDE1Q9NZC3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
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