Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA3

GOLGA6A, Golgin subfamily A member 6A, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6AQ9NYA3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GOLGA6AQ9NYA3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GOLGA6AQ9NYA3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GOLGA6AQ9NYA3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GOLGA6AQ9NYA3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6AQ9NYA3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GOLGA6AQ9NYA3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GOLGA6AQ9NYA3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GOLGA6AQ9NYA3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GOLGA6AQ9NYA3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6AQ9NYA3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6AQ9NYA3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6AQ9NYA3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6AQ9NYA3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6AQ9NYA3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6AQ9NYA3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6AQ9NYA3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6AQ9NYA3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6AQ9NYA3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6AQ9NYA3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA6AQ9NYA3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA6AQ9NYA3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA6AQ9NYA3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA6AQ9NYA3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA6AQ9NYA3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA6AQ9NYA3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA6AQ9NYA3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6AQ9NYA3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6AQ9NYA3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6AQ9NYA3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6AQ9NYA3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6AQ9NYA3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6AQ9NYA3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6AQ9NYA3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6AQ9NYA3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6AQ9NYA3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6AQ9NYA3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA6AQ9NYA3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6AQ9NYA3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6AQ9NYA3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6AQ9NYA3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms