Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAS3

SLC28A3, Solute carrier family 28 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A3Q9HAS3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC28A3Q9HAS3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC28A3Q9HAS3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC28A3Q9HAS3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC28A3Q9HAS3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC28A3Q9HAS3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC28A3Q9HAS3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC28A3Q9HAS3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC28A3Q9HAS3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC28A3Q9HAS3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC28A3Q9HAS3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC28A3Q9HAS3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC28A3Q9HAS3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC28A3Q9HAS3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC28A3Q9HAS3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC28A3Q9HAS3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC28A3Q9HAS3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC28A3Q9HAS3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC28A3Q9HAS3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC28A3Q9HAS3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC28A3Q9HAS3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC28A3Q9HAS3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC28A3Q9HAS3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC28A3Q9HAS3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC28A3Q9HAS3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC28A3Q9HAS3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC28A3Q9HAS3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC28A3Q9HAS3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC28A3Q9HAS3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC28A3Q9HAS3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC28A3Q9HAS3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC28A3Q9HAS3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC28A3Q9HAS3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC28A3Q9HAS3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC28A3Q9HAS3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms