Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ROPN1BQ9BZX4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ROPN1BQ9BZX4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ROPN1BQ9BZX4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms