Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXU9

CALN1, Calcium-binding protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALN1Q9BXU9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALN1Q9BXU9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALN1Q9BXU9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALN1Q9BXU9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALN1Q9BXU9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALN1Q9BXU9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALN1Q9BXU9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALN1Q9BXU9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALN1Q9BXU9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALN1Q9BXU9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALN1Q9BXU9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CALN1Q9BXU9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALN1Q9BXU9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALN1Q9BXU9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALN1Q9BXU9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CALN1Q9BXU9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CALN1Q9BXU9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALN1Q9BXU9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALN1Q9BXU9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALN1Q9BXU9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALN1Q9BXU9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALN1Q9BXU9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALN1Q9BXU9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALN1Q9BXU9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALN1Q9BXU9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALN1Q9BXU9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALN1Q9BXU9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CALN1Q9BXU9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALN1Q9BXU9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALN1Q9BXU9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALN1Q9BXU9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALN1Q9BXU9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALN1Q9BXU9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CALN1Q9BXU9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CALN1Q9BXU9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CALN1Q9BXU9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms