Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SALL3Q9BXA9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SALL3Q9BXA9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SALL3Q9BXA9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms