Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC94Q9BW85 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC94Q9BW85 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC94Q9BW85 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms