Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SDF4Q9BRK5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SDF4Q9BRK5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms