Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SGIP1Q9BQI5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SGIP1Q9BQI5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SGIP1Q9BQI5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms