Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSMD1Q99460 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMD1Q99460 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSMD1Q99460 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSMD1Q99460 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSMD1Q99460 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PSMD1Q99460 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PSMD1Q99460 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSMD1Q99460 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PSMD1Q99460 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PSMD1Q99460 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PSMD1Q99460 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PSMD1Q99460 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PSMD1Q99460 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PSMD1Q99460 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PSMD1Q99460 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PSMD1Q99460 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PSMD1Q99460 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PSMD1Q99460 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PSMD1Q99460 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PSMD1Q99460 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PSMD1Q99460 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PSMD1Q99460 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PSMD1Q99460 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PSMD1Q99460 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PSMD1Q99460 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PSMD1Q99460 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PSMD1Q99460 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.3 ms