Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT9

IFT43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT43Q96FT9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFT43Q96FT9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFT43Q96FT9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms