Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT7

ASIC4, Acid-sensing ion channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC4Q96FT7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ASIC4Q96FT7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASIC4Q96FT7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASIC4Q96FT7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms