Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED2

Bloc1s4, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bloc1s4Q8VED2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bloc1s4Q8VED2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Bloc1s4Q8VED2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Bloc1s4Q8VED2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Bloc1s4Q8VED2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bloc1s4Q8VED2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bloc1s4Q8VED2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bloc1s4Q8VED2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bloc1s4Q8VED2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bloc1s4Q8VED2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bloc1s4Q8VED2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bloc1s4Q8VED2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bloc1s4Q8VED2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bloc1s4Q8VED2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bloc1s4Q8VED2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bloc1s4Q8VED2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bloc1s4Q8VED2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bloc1s4Q8VED2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bloc1s4Q8VED2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bloc1s4Q8VED2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bloc1s4Q8VED2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bloc1s4Q8VED2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bloc1s4Q8VED2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bloc1s4Q8VED2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bloc1s4Q8VED2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bloc1s4Q8VED2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bloc1s4Q8VED2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bloc1s4Q8VED2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bloc1s4Q8VED2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bloc1s4Q8VED2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bloc1s4Q8VED2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bloc1s4Q8VED2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bloc1s4Q8VED2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bloc1s4Q8VED2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bloc1s4Q8VED2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bloc1s4Q8VED2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bloc1s4Q8VED2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bloc1s4Q8VED2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bloc1s4Q8VED2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bloc1s4Q8VED2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bloc1s4Q8VED2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bloc1s4Q8VED2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bloc1s4Q8VED2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bloc1s4Q8VED2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms