Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ZNF248Q8NDW4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF248Q8NDW4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF248Q8NDW4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
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