Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY92

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, humanhuman

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4Q8IY92 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLX4Q8IY92 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLX4Q8IY92 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms