Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HERC6Q8IVU3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERC6Q8IVU3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms