Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMC4Q7Z404 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms