Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B1

NEGR1, Neuronal growth regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEGR1Q7Z3B1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NEGR1Q7Z3B1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEGR1Q7Z3B1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms