Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNI2Q6ZMN8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCNI2Q6ZMN8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNI2Q6ZMN8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms