Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CXCL17Q6UXB2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CXCL17Q6UXB2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms