Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USPL1Q5W0Q7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USPL1Q5W0Q7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms