Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ISXQ2M1V0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ISXQ2M1V0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms