Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLAMF1Q13291 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLAMF1Q13291 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms