Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sox13Q04891 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox13Q04891 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms