Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F1Q01094 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F1Q01094 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms