Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBXN2AP68543 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBXN2AP68543 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBXN2AP68543 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms