Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HERVK_113P61574 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HERVK_113P61574 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms