Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA9P57773 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA9P57773 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA9P57773 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA9P57773 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA9P57773 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA9P57773 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA9P57773 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA9P57773 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA9P57773 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA9P57773 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJA9P57773 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJA9P57773 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJA9P57773 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJA9P57773 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJA9P57773 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJA9P57773 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GJA9P57773 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJA9P57773 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GJA9P57773 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJA9P57773 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJA9P57773 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJA9P57773 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJA9P57773 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJA9P57773 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJA9P57773 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJA9P57773 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GJA9P57773 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJA9P57773 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJA9P57773 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJA9P57773 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJA9P57773 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GJA9P57773 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA9P57773 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA9P57773 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA9P57773 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA9P57773 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA9P57773 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA9P57773 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA9P57773 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA9P57773 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA9P57773 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA9P57773 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA9P57773 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA9P57773 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA9P57773 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA9P57773 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA9P57773 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA9P57773 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA9P57773 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA9P57773 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA9P57773 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA9P57773 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA9P57773 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJA9P57773 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJA9P57773 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJA9P57773 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJA9P57773 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJA9P57773 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJA9P57773 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJA9P57773 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJA9P57773 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJA9P57773 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJA9P57773 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA9P57773 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA9P57773 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA9P57773 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA9P57773 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA9P57773 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA9P57773 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA9P57773 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA9P57773 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA9P57773 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA9P57773 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA9P57773 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA9P57773 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA9P57773 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA9P57773 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA9P57773 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA9P57773 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA9P57773 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA9P57773 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA9P57773 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA9P57773 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA9P57773 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA9P57773 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA9P57773 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA9P57773 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA9P57773 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA9P57773 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA9P57773 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA9P57773 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA9P57773 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA9P57773 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA9P57773 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA9P57773 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA9P57773 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA9P57773 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA9P57773 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA9P57773 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms