Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AFMP43652 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AFMP43652 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AFMP43652 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AFMP43652 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AFMP43652 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AFMP43652 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AFMP43652 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AFMP43652 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AFMP43652 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AFMP43652 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AFMP43652 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AFMP43652 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AFMP43652 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AFMP43652 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AFMP43652 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AFMP43652 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AFMP43652 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AFMP43652 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
AFMP43652 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AFMP43652 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AFMP43652 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AFMP43652 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AFMP43652 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
AFMP43652 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AFMP43652 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AFMP43652 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AFMP43652 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AFMP43652 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AFMP43652 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
AFMP43652 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AFMP43652 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AFMP43652 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AFMP43652 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AFMP43652 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AFMP43652 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AFMP43652 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AFMP43652 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AFMP43652 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AFMP43652 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AFMP43652 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AFMP43652 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AFMP43652 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AFMP43652 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AFMP43652 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AFMP43652 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AFMP43652 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AFMP43652 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AFMP43652 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AFMP43652 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AFMP43652 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AFMP43652 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AFMP43652 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AFMP43652 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
AFMP43652 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AFMP43652 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AFMP43652 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AFMP43652 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AFMP43652 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AFMP43652 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AFMP43652 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AFMP43652 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AFMP43652 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AFMP43652 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AFMP43652 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AFMP43652 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
AFMP43652 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AFMP43652 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AFMP43652 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AFMP43652 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AFMP43652 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AFMP43652 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AFMP43652 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AFMP43652 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AFMP43652 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AFMP43652 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AFMP43652 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AFMP43652 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AFMP43652 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AFMP43652 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AFMP43652 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AFMP43652 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AFMP43652 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AFMP43652 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AFMP43652 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AFMP43652 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AFMP43652 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AFMP43652 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AFMP43652 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AFMP43652 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AFMP43652 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AFMP43652 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AFMP43652 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AFMP43652 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AFMP43652 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AFMP43652 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFMP43652 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFMP43652 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFMP43652 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFMP43652 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms