Protein–RNA interactions for Protein: P40937

RFC5, Replication factor C subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC5P40937 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFC5P40937 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFC5P40937 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFC5P40937 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFC5P40937 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RFC5P40937 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFC5P40937 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFC5P40937 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RFC5P40937 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFC5P40937 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFC5P40937 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFC5P40937 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFC5P40937 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFC5P40937 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFC5P40937 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFC5P40937 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RFC5P40937 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFC5P40937 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFC5P40937 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFC5P40937 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RFC5P40937 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFC5P40937 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFC5P40937 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RFC5P40937 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFC5P40937 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RFC5P40937 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RFC5P40937 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RFC5P40937 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RFC5P40937 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFC5P40937 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFC5P40937 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFC5P40937 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFC5P40937 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFC5P40937 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFC5P40937 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFC5P40937 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFC5P40937 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFC5P40937 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFC5P40937 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFC5P40937 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFC5P40937 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFC5P40937 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFC5P40937 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFC5P40937 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFC5P40937 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFC5P40937 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFC5P40937 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFC5P40937 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFC5P40937 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFC5P40937 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFC5P40937 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFC5P40937 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFC5P40937 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFC5P40937 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFC5P40937 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFC5P40937 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFC5P40937 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFC5P40937 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFC5P40937 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RFC5P40937 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RFC5P40937 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFC5P40937 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFC5P40937 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFC5P40937 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFC5P40937 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RFC5P40937 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFC5P40937 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFC5P40937 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFC5P40937 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFC5P40937 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFC5P40937 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFC5P40937 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RFC5P40937 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RFC5P40937 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFC5P40937 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RFC5P40937 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RFC5P40937 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFC5P40937 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFC5P40937 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFC5P40937 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFC5P40937 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFC5P40937 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFC5P40937 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFC5P40937 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFC5P40937 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RFC5P40937 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RFC5P40937 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RFC5P40937 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RFC5P40937 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFC5P40937 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFC5P40937 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFC5P40937 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFC5P40937 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFC5P40937 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFC5P40937 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFC5P40937 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFC5P40937 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFC5P40937 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFC5P40937 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFC5P40937 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms