Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 AL357833.2-202ENST00000413757 372 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 AC093581.1-204ENST00000442606 390 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 ETFRF1-209ENST00000556885 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 BOLL-205ENST00000433157 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 AC098483.1-201ENST00000438623 955 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 AP001830.1-201ENST00000528717 692 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 AC008567.2-201ENST00000589751 656 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD11P31277 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms