Protein–RNA interactions for Protein: P25440

BRD2, Bromodomain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD2P25440 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRD2P25440 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD2P25440 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD2P25440 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD2P25440 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD2P25440 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD2P25440 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD2P25440 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD2P25440 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD2P25440 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD2P25440 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD2P25440 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD2P25440 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD2P25440 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD2P25440 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD2P25440 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD2P25440 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD2P25440 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD2P25440 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD2P25440 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRD2P25440 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRD2P25440 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRD2P25440 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRD2P25440 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BRD2P25440 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRD2P25440 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRD2P25440 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRD2P25440 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRD2P25440 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRD2P25440 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRD2P25440 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRD2P25440 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRD2P25440 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRD2P25440 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRD2P25440 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRD2P25440 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRD2P25440 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BRD2P25440 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRD2P25440 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRD2P25440 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRD2P25440 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRD2P25440 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRD2P25440 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRD2P25440 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRD2P25440 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRD2P25440 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRD2P25440 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRD2P25440 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRD2P25440 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRD2P25440 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRD2P25440 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRD2P25440 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRD2P25440 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRD2P25440 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRD2P25440 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRD2P25440 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRD2P25440 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRD2P25440 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
BRD2P25440 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRD2P25440 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRD2P25440 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRD2P25440 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRD2P25440 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
BRD2P25440 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRD2P25440 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRD2P25440 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRD2P25440 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRD2P25440 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRD2P25440 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRD2P25440 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRD2P25440 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRD2P25440 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRD2P25440 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRD2P25440 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRD2P25440 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRD2P25440 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRD2P25440 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRD2P25440 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRD2P25440 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRD2P25440 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRD2P25440 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRD2P25440 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRD2P25440 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRD2P25440 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRD2P25440 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRD2P25440 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRD2P25440 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRD2P25440 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRD2P25440 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRD2P25440 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRD2P25440 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRD2P25440 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRD2P25440 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BRD2P25440 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRD2P25440 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRD2P25440 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRD2P25440 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRD2P25440 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRD2P25440 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRD2P25440 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms