Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB5AP20339 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB5AP20339 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB5AP20339 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms