Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ESRRAP11474 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ESRRAP11474 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ESRRAP11474 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms