Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHRNB1P11230 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNB1P11230 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms