Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GLI3P10071 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GLI3P10071 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GLI3P10071 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
GLI3P10071 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GLI3P10071 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
GLI3P10071 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GLI3P10071 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GLI3P10071 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
GLI3P10071 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
GLI3P10071 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GLI3P10071 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GLI3P10071 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
GLI3P10071 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
GLI3P10071 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
GLI3P10071 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GLI3P10071 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GLI3P10071 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GLI3P10071 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GLI3P10071 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
GLI3P10071 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GLI3P10071 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GLI3P10071 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GLI3P10071 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GLI3P10071 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GLI3P10071 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GLI3P10071 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GLI3P10071 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GLI3P10071 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
GLI3P10071 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GLI3P10071 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GLI3P10071 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GLI3P10071 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GLI3P10071 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GLI3P10071 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GLI3P10071 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GLI3P10071 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GLI3P10071 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GLI3P10071 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GLI3P10071 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GLI3P10071 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GLI3P10071 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GLI3P10071 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
GLI3P10071 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GLI3P10071 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GLI3P10071 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GLI3P10071 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GLI3P10071 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GLI3P10071 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
GLI3P10071 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GLI3P10071 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GLI3P10071 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GLI3P10071 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GLI3P10071 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GLI3P10071 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GLI3P10071 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GLI3P10071 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GLI3P10071 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GLI3P10071 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GLI3P10071 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GLI3P10071 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
GLI3P10071 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
GLI3P10071 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
GLI3P10071 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
GLI3P10071 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
GLI3P10071 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GLI3P10071 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
GLI3P10071 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GLI3P10071 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GLI3P10071 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GLI3P10071 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GLI3P10071 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GLI3P10071 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GLI3P10071 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GLI3P10071 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GLI3P10071 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GLI3P10071 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GLI3P10071 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GLI3P10071 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GLI3P10071 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GLI3P10071 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
GLI3P10071 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
GLI3P10071 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GLI3P10071 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GLI3P10071 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GLI3P10071 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GLI3P10071 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GLI3P10071 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GLI3P10071 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GLI3P10071 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
GLI3P10071 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GLI3P10071 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GLI3P10071 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GLI3P10071 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GLI3P10071 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GLI3P10071 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GLI3P10071 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GLI3P10071 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GLI3P10071 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GLI3P10071 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms