Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CENPBP07199 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CENPBP07199 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CENPBP07199 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CENPBP07199 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CENPBP07199 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CENPBP07199 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CENPBP07199 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CENPBP07199 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CENPBP07199 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CENPBP07199 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CENPBP07199 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CENPBP07199 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CENPBP07199 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CENPBP07199 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CENPBP07199 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
CENPBP07199 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
CENPBP07199 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CENPBP07199 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CENPBP07199 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CENPBP07199 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CENPBP07199 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CENPBP07199 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CENPBP07199 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CENPBP07199 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CENPBP07199 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CENPBP07199 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CENPBP07199 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CENPBP07199 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CENPBP07199 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CENPBP07199 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CENPBP07199 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CENPBP07199 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CENPBP07199 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CENPBP07199 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CENPBP07199 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CENPBP07199 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CENPBP07199 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CENPBP07199 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CENPBP07199 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CENPBP07199 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CENPBP07199 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CENPBP07199 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CENPBP07199 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CENPBP07199 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CENPBP07199 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CENPBP07199 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CENPBP07199 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
CENPBP07199 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CENPBP07199 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CENPBP07199 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CENPBP07199 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CENPBP07199 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CENPBP07199 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CENPBP07199 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CENPBP07199 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CENPBP07199 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CENPBP07199 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CENPBP07199 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CENPBP07199 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CENPBP07199 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CENPBP07199 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CENPBP07199 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CENPBP07199 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CENPBP07199 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CENPBP07199 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CENPBP07199 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CENPBP07199 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CENPBP07199 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CENPBP07199 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CENPBP07199 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CENPBP07199 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CENPBP07199 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CENPBP07199 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CENPBP07199 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CENPBP07199 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CENPBP07199 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CENPBP07199 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CENPBP07199 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CENPBP07199 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CENPBP07199 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CENPBP07199 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CENPBP07199 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CENPBP07199 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CENPBP07199 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CENPBP07199 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CENPBP07199 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CENPBP07199 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CENPBP07199 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CENPBP07199 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CENPBP07199 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CENPBP07199 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CENPBP07199 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CENPBP07199 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CENPBP07199 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CENPBP07199 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CENPBP07199 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CENPBP07199 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CENPBP07199 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CENPBP07199 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms