Protein–RNA interactions for Protein: O95967

EFEMP2, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP2O95967 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFEMP2O95967 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EFEMP2O95967 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EFEMP2O95967 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EFEMP2O95967 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EFEMP2O95967 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EFEMP2O95967 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EFEMP2O95967 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EFEMP2O95967 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EFEMP2O95967 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EFEMP2O95967 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFEMP2O95967 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFEMP2O95967 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFEMP2O95967 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFEMP2O95967 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFEMP2O95967 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFEMP2O95967 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFEMP2O95967 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EFEMP2O95967 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms