Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF6O94906 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF6O94906 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRPF6O94906 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms