Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITX3O75364 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITX3O75364 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PITX3O75364 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITX3O75364 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITX3O75364 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITX3O75364 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITX3O75364 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITX3O75364 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PITX3O75364 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITX3O75364 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITX3O75364 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITX3O75364 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITX3O75364 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITX3O75364 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITX3O75364 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITX3O75364 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PITX3O75364 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITX3O75364 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITX3O75364 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITX3O75364 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PITX3O75364 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITX3O75364 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITX3O75364 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITX3O75364 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITX3O75364 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITX3O75364 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITX3O75364 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITX3O75364 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PITX3O75364 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITX3O75364 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITX3O75364 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITX3O75364 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITX3O75364 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITX3O75364 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PITX3O75364 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITX3O75364 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITX3O75364 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITX3O75364 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITX3O75364 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITX3O75364 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITX3O75364 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITX3O75364 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITX3O75364 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITX3O75364 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PITX3O75364 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PITX3O75364 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PITX3O75364 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PITX3O75364 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PITX3O75364 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITX3O75364 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITX3O75364 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITX3O75364 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITX3O75364 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITX3O75364 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PITX3O75364 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITX3O75364 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITX3O75364 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITX3O75364 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITX3O75364 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITX3O75364 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITX3O75364 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITX3O75364 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITX3O75364 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITX3O75364 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITX3O75364 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITX3O75364 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITX3O75364 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PITX3O75364 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX3O75364 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX3O75364 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX3O75364 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX3O75364 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX3O75364 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX3O75364 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX3O75364 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX3O75364 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX3O75364 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX3O75364 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX3O75364 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX3O75364 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX3O75364 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PITX3O75364 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX3O75364 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX3O75364 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX3O75364 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX3O75364 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX3O75364 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX3O75364 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX3O75364 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX3O75364 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX3O75364 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX3O75364 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX3O75364 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX3O75364 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX3O75364 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX3O75364 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX3O75364 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX3O75364 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PITX3O75364 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms