Protein–RNA interactions for Protein: O60383

GDF9, Growth/differentiation factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF9O60383 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF9O60383 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF9O60383 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF9O60383 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF9O60383 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF9O60383 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF9O60383 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDF9O60383 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF9O60383 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF9O60383 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF9O60383 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF9O60383 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDF9O60383 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF9O60383 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF9O60383 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF9O60383 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF9O60383 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF9O60383 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF9O60383 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF9O60383 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF9O60383 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF9O60383 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF9O60383 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF9O60383 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF9O60383 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF9O60383 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF9O60383 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF9O60383 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDF9O60383 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF9O60383 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF9O60383 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF9O60383 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF9O60383 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF9O60383 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF9O60383 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF9O60383 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF9O60383 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF9O60383 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDF9O60383 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF9O60383 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF9O60383 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF9O60383 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF9O60383 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF9O60383 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDF9O60383 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF9O60383 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF9O60383 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF9O60383 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF9O60383 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF9O60383 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF9O60383 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF9O60383 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDF9O60383 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF9O60383 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF9O60383 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF9O60383 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF9O60383 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF9O60383 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF9O60383 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF9O60383 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF9O60383 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF9O60383 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDF9O60383 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF9O60383 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF9O60383 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF9O60383 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF9O60383 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF9O60383 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF9O60383 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF9O60383 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF9O60383 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF9O60383 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF9O60383 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF9O60383 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF9O60383 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF9O60383 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDF9O60383 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF9O60383 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF9O60383 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF9O60383 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF9O60383 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF9O60383 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF9O60383 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF9O60383 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF9O60383 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF9O60383 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF9O60383 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF9O60383 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF9O60383 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF9O60383 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF9O60383 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF9O60383 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF9O60383 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDF9O60383 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF9O60383 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF9O60383 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF9O60383 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF9O60383 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF9O60383 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDF9O60383 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms