Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB3O43889 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB3O43889 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CREB3O43889 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CREB3O43889 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CREB3O43889 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CREB3O43889 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CREB3O43889 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CREB3O43889 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CREB3O43889 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CREB3O43889 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CREB3O43889 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CREB3O43889 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CREB3O43889 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CREB3O43889 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CREB3O43889 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CREB3O43889 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CREB3O43889 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CREB3O43889 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CREB3O43889 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CREB3O43889 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CREB3O43889 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CREB3O43889 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CREB3O43889 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CREB3O43889 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CREB3O43889 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CREB3O43889 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CREB3O43889 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CREB3O43889 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CREB3O43889 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB3O43889 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB3O43889 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB3O43889 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB3O43889 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB3O43889 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB3O43889 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB3O43889 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB3O43889 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB3O43889 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB3O43889 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB3O43889 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB3O43889 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB3O43889 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB3O43889 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB3O43889 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB3O43889 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB3O43889 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CREB3O43889 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CREB3O43889 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CREB3O43889 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CREB3O43889 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CREB3O43889 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CREB3O43889 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CREB3O43889 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CREB3O43889 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CREB3O43889 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CREB3O43889 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CREB3O43889 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CREB3O43889 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CREB3O43889 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CREB3O43889 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CREB3O43889 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CREB3O43889 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CREB3O43889 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CREB3O43889 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CREB3O43889 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CREB3O43889 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CREB3O43889 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CREB3O43889 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CREB3O43889 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CREB3O43889 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CREB3O43889 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CREB3O43889 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CREB3O43889 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CREB3O43889 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CREB3O43889 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CREB3O43889 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CREB3O43889 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CREB3O43889 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CREB3O43889 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CREB3O43889 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CREB3O43889 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CREB3O43889 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CREB3O43889 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CREB3O43889 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CREB3O43889 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CREB3O43889 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CREB3O43889 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CREB3O43889 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CREB3O43889 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CREB3O43889 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CREB3O43889 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3O43889 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3O43889 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3O43889 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3O43889 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3O43889 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3O43889 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3O43889 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3O43889 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms