Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
FOXO3O43524 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
FOXO3O43524 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
FOXO3O43524 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
FOXO3O43524 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
FOXO3O43524 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
FOXO3O43524 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
FOXO3O43524 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
FOXO3O43524 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
FOXO3O43524 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
FOXO3O43524 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
FOXO3O43524 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
FOXO3O43524 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
FOXO3O43524 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
FOXO3O43524 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
FOXO3O43524 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
FOXO3O43524 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
FOXO3O43524 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
FOXO3O43524 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
FOXO3O43524 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
FOXO3O43524 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
FOXO3O43524 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
FOXO3O43524 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
FOXO3O43524 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
FOXO3O43524 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
FOXO3O43524 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
FOXO3O43524 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
FOXO3O43524 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
FOXO3O43524 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
FOXO3O43524 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
FOXO3O43524 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
FOXO3O43524 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.57
FOXO3O43524 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
FOXO3O43524 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
FOXO3O43524 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
FOXO3O43524 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
FOXO3O43524 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
FOXO3O43524 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
FOXO3O43524 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
FOXO3O43524 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
FOXO3O43524 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
FOXO3O43524 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
FOXO3O43524 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
FOXO3O43524 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
FOXO3O43524 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
FOXO3O43524 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
FOXO3O43524 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
FOXO3O43524 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
FOXO3O43524 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
FOXO3O43524 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
FOXO3O43524 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
FOXO3O43524 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
FOXO3O43524 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
FOXO3O43524 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
FOXO3O43524 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
FOXO3O43524 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
FOXO3O43524 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
FOXO3O43524 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
FOXO3O43524 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
FOXO3O43524 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
FOXO3O43524 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
FOXO3O43524 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
FOXO3O43524 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
FOXO3O43524 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
FOXO3O43524 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
FOXO3O43524 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
FOXO3O43524 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
FOXO3O43524 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
FOXO3O43524 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
FOXO3O43524 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
FOXO3O43524 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
FOXO3O43524 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
FOXO3O43524 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
FOXO3O43524 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
FOXO3O43524 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
FOXO3O43524 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC31.01■■■□□ 2.55
FOXO3O43524 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
FOXO3O43524 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
FOXO3O43524 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
FOXO3O43524 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
FOXO3O43524 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
FOXO3O43524 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC31■■■□□ 2.55
FOXO3O43524 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
FOXO3O43524 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC31■■■□□ 2.55
FOXO3O43524 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
FOXO3O43524 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC31■■■□□ 2.55
FOXO3O43524 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
FOXO3O43524 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
FOXO3O43524 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
FOXO3O43524 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
FOXO3O43524 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
FOXO3O43524 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
FOXO3O43524 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
FOXO3O43524 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
FOXO3O43524 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
FOXO3O43524 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
FOXO3O43524 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
FOXO3O43524 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
FOXO3O43524 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
FOXO3O43524 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms