Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CLOCKO15516 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CLOCKO15516 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.9 ms